KI-Tool Helixer revolutioniert Genannotation

von | Jan. 27, 2026 | Digitalisierung, Forschung

Wissenschaftler des Forschungszentrums Jülich und der Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf haben das Tool Helixer entwickelt. Das Besondere: Es bestimmt Gene direkt aus DNA-Sequenzen, ohne Laborversuche oder Vorwissen über den Organismus. Der Prozess der strukturellen Genannotation wird dadurch vereinfacht und beschleunigt.

Die KI erkennt Merkmale wie Start- und Stoppsignale, nicht-translatierte Bereiche, kodierende DNA-Sequenzen und Introns. Helixer ist das erste KI-Tool, das Gene in Organismen von Pflanzen und Pilzen über Insekten bis zu Wirbeltieren zuverlässig annotiert. Es erreicht nahezu die Qualität manuell kuratierter Referenzannotationen und übertrifft etablierte Werkzeuge bei Wirbeltieren sowie bei Pflanzen durch Deep-Learning-Ansätze.

Symbolbild. Credits: freepik
Symbolbild. Credits: freepik

Das Konzept stammt aus 2020 und wurde zu einem praktisch nutzbaren Tool weiterentwickelt. Die Ergebnisse erschienen als Preprint auf bioRxiv und nun in Nature Methods. Helixer wird in Projekten von Nutzpflanzen bis Insekten eingesetzt. Zukünftige Erweiterungen sind geplant.

Anwendungen umfassen Landwirtschaft, Umweltschutz und Biotechnologie. Das Tool ergänzt bestehende Methoden und liefert neue Erkenntnisse auch bei gut erforschten Arten.

Original Paper:

Helixer: ab initio prediction of primary eukaryotic gene models combining deep learning and a hidden Markov model | Nature Methods


Redaktion: X-Press Journalistenbüro GbR

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